近五年承担的主要科研项目：

1. 国家自然科学基金-大动物模型专项项目，81941012，基于错误折叠蛋白的朊蛋白特性建立神经退行性疾病的恒河猴模型，2020年1月-2022年12月，100万，牵头。

2. 科技部国家重点研发计划-2019-nCoV应急科技攻关任务，2020YFC0841100，2019-nCoV动物模型构建，2020年1月-2020年12月，1260万，牵头。

3. 中国医学科学院中央级基本科研业务费（基地平台建设），2019PT310009，疾病模型复合免疫系统基因修饰小鼠资源创制，2019年1月-2019年12月，100万，牵头。

4. 中国医学科学院中央级基本科研业务费，2018JT35001，基于动物模型的疫苗药物有效性评价标准的制定，2018年9月-2018年12月，150万，牵头。

5. 中国医学科学院中央级基本科研业务费，201831PT008，人类疾病动物模型比较医学分析技术体系的建立，2018年1月-2019年1月，100万，牵头。

6. 中国医学科学院中央级基本科研业务费，2017PT31048，人类疾病动物模型比较医学分析技术体系的建立，2017年3月-2018年3月，100万，牵头。

7. 北京市自然科学基金委，5171001，食蟹猴帕金森动物模型自体脂肪干细胞治疗方法探讨，2017年1月-2020年12月，80万，牵头。

8. 国家自然科学基金面上项目，81672039，人肠道病毒71型入侵神经系统的细胞突触途径的研究，2017年1月-2020年12月，82万，牵头。

9. 中国医学科学院医学与健康科技创新工程，2016-I2M-2-006，人类疾病动物模型资源创制，2016年9月-2020年12月，4050万，牵头。

10. 科技部国家863 计划，2015AA021105，人与动物血液样品差异性光谱特征数据库和数学模型的建立，2015年1月-2017年12月，426万，牵头。

专利（近五年）：

1.  一种啮齿类动物脑内微透析记录的清醒活动装置，实用新型专利，ZL 2021 2 1027247.4，2021年6月授权。

2. IL-1F7a的作用，发明专利，ZL 2016 1 1051266.4，2019年9月授权。

3. GS-9620的用途，发明专利，ZL 2016 1 1005893.4，2019年4月授权。

4. 一种引物组及其在扩增SIV/SHIV基因组中的应用与试剂盒，发明专利，ZL 2016 1 0041772.9，2018年10月授权。

5. 一种实验动物的转运设备，实用新型专利，ZL 2017 2 0402688.5，2018年6月授权。

6. 一种重组免疫缺陷质粒和病毒以及应用，发明专利，ZL 2014 1 0471676.9，2017年6月授权。

7. 一种新的哮喘动物模型的制备方法，发明专利，ZL 2014 1 0522117.6，2017年6月授权。

8. 流感病毒H5N1亚型和H7N9亚型的液相芯片检测试剂盒，发明专利，ZL 2014 1 0777884.1，2016年8月授权。

专著（近五年）：

1. 实验动物科学丛书《动物生物安全实验室操作指南》，秦川，科学出版社，2020年4月。

2. 百科全书系列《中华医学百科全书-医学实验动物学分卷》，秦川，科学出版社，2018年12月。

3. 实验动物科学丛书《实验动物疾病》， 秦川、高虹，科学出版社，2018年9月。

4. 《中国实验动物学会团体标准汇编（及实施指南）》第一卷、第二卷、第三卷，秦川，科学出版社，2018年3月至12月。

5. 实验动物科学丛书《实验动物比较组织学彩色图谱》，秦川，科学出版社，2017年1月。

6. 实验动物科学丛书《实验室生物安全事故防范和管理》，秦川，科学出版社，2017年1月。

7. 《实验动物专业技术人员等级培训教材》初级卷、中级卷、高级卷，秦川，中国协和医科大学出版社，2016年12月至2017年8月。

8. 《实验动物学词典》，秦川，中国质检出版社/中国标准出版社，2016年11月。

9. 中国科协项目科普图书《我们身边的人兽共患病》，秦川，科学普及出版社，2016年4月。

10. 《实验动物学学科发展报告》，秦川，中国科协资助项目，中国科学技术出版社，2016年4月。　

11. 《实验动物科学技术与产业发展战略研究》，夏咸柱、秦川、钱军，中国工程院重点咨询项目，科学出版社，2016年3月。

12.  国家级规划教材，八年制教材，北京协和医学院特色教育丛书《实验动物学》，秦川，中国协和医科大学出版社，2016年1月。

科研和教学表彰（近五年）：

1. 北京协和医学院教学名师，2020年。 

2. 国家科学技术进步奖，二等奖，人类重大传染病动物模型体系的建立及应用，2019年。

3. 麒麟科学技术奖-首都优秀科技创新奖，2019年。

4. 全国三八红旗手标兵荣誉称号，2018年。

5. 最美科技工作者，2018年。

6. 中华医学科技奖，二等奖，人类重大传染病动物模型体系的建立及应用，2018年。

7. 北京市科学技术奖，三等奖，基于CRISPR-Cas9的大鼠精确基因编辑技术体系的建立及应用，2018年。

8. 全国创新争先奖，2017年。

9. 中华人民共和国教育部科学技术进步奖，二等奖，重大传染病动物模型资源库的建立及应用，2016年。

近五年部分代表性成果：

1.    Gao Q, Bao L, Mao H, et al. Development of an inactivated vaccine candidate for SARS-CoV-2. Science. 2020;369(6499):77-81.

2.    Deng W, Bao L, Liu J, et al. Primary exposure to SARS-CoV-2 protects against reinfection in rhesus macaques. Science. 2020;eabc5343.

3.    Cao Y, Su B, Guo X, et al. Potent Neutralizing Antibodies against SARS-CoV-2 Identified by High-Throughput Single-Cell Sequencing of Convalescent Patients' B Cells. Cell. 2020;182(1):73-84.e16.

4.    Dai L, Zheng T, Xu K, et al. A Universal Design of Beta coronavirus Vaccines against COVID-19, MERS, and SARS. Cell. 2020;S0092-8674(20)30812-6.

5.    Wang H, Zhang Y, Huang B, et al.Development of an inactivated vaccine candidate, BBIBP-CorV, with potent protection against SARS-CoV-2. Cell. [published online ahead of print, 2020 Jun6]. doi:10.1016/j.cell.2020.06.008

6.    Bao L, Deng W, Huang B, et al. The pathogenicity of SARS-CoV-2 in hACE2 transgenic mice [published online ahead ofprint, 2020 May 7]. Nature. 2020;10.1038/s41586-020-2312-y.

7.    Guo J, Xiong Y, Shi C, et al. Characteristics of airborne bacterial communities in indoor and outdoor environments during continuous haze events in Beijing:Implications for health care. Environ Int. 2020;139:105721.

8.    Guan Q, Zhan L, Liu ZH, et al. Identification of pyrvinium pamoate as an anti-tuberculosis agent in vitro and in vivo by SOSA approach amongst known drugs. Emerg Microbes Infect. 2020;9(1):302-312.

9.    Bao L, Bi Y, Wong G, et al. Diverse biological characteristics and varied virulence ofH7N9 from Wave 5. Emerg Microbes Infect. 2019;8(1):94-102.

10.    Yang W, Liu Y, Tu Z, et al. CRISPR/Cas9-mediated PINK1 deletion leads to neurodegeneration in rhesus monkeys. Cell Res. 2019;29(4):334-336.

11.    Chong H, Xue J, Zhu Y, et al. Monotherapy with a low-dose lipopeptide HIV fusion inhibitor maintains long-term viral suppression in rhesus macaques. PLoS Pathog. 2019;15(2):e1007552.

12.    Deng W, Guan G, Xiao C, et al. Construction of a comprehensive observer-based scale assessing aging-related health and functioning in captive rhesus macaques.Aging (Albany NY). 2019;11(17):6892-6903.

13.    Chen W, Zhang L, Shi C, Ren G, Kong Q, Qin C.Comprehensive analysis of hippocampal miRNAomes in humans and mice. Epigenomics.2018;10(6):813-828.

14.    Zhang L, Wang Y, Xiayu X, et al. Altered GutMicrobiota in a Mouse Model of Alzheimer's Disease. J Alzheimers Dis.2017;60(4):1241-1257.

15.    Chen Z, Bao L, Chen C, et al. Human Neutralizing Monoclonal Antibody Inhibition ofMiddle East Respiratory Syndrome Coronavirus Replication in the Common Marmoset. J Infect Dis. 2017;215(12):1807-1815.

16.    Yeung ML, Yao Y, Jia L, et al. MERS coronavirus induces apoptosis in kidney and lung by upregulating Smad7 andFGF2. Nat Microbiol. 2016;1(3):16004.

17.    Song N, Zhang L, Chen W, et al. Cyanidin 3-O-β-glucopyranoside activates peroxisome proliferator-activated receptor-γ and alleviates cognitive impairment in theAPP(swe)/PS1(ΔE9) mouse model. Biochim Biophys Acta.2016;1862(9):1786-1800.

18.     Liu Y, Snedecor ER, Zhang X, et al.Correction of Hair Shaft Defects through Allele-Specific Silencing of MutantKrt75. J Invest Dermatol. 2016;136(1):45-51.

19.    Liu Y,Snedecor ER, Choi YJ, et al. Gorab Is Required for Dermal Condensate Cells toRespond to Hedgehog Signals during Hair Follicle Morphogenesis. J InvestDermatol. 2016;136(2):378-386.

20.    Chen W, Xia X, Song N, et al. Cross-SpeciesAnalysis of Gene Expression and Function in Prefrontal Cortex, Hippocampus and Striatum. PLoS One. 2016;11(10):e0164295.