导师风采
李姣
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个人信息

Personal Information

  • 研究员
  • 导师类别:博士生导师
  • 性别: 女
  • 学历:博士研究生
  • 学位:博士

联系方式

Contact Information

  • 所属院系:医学信息研究所
  • 所属专业: 医学信息学
  • 邮箱 : li.jiao@imicams.ac.cn
  • 工作电话 : 010-52328740

个人简介

Personal Profile

李姣博士,研究员,博士生导师。中国医学科学院医学信息研究所,医学信息创新研究中心主任,医学智能计算研究室主任。长期从事医学信息学研究,开展医学大数据感知与医学知识图谱构建关键技术研发。担任中华医学会医学信息学分会副主任委员,医学大数据与人工智能学组组长,中国预防医学会生物信息学分会委员,中国自动化学会智能健康与生物信息专业委员会委员,中国中文信息学会医疗健康与生物信息处理专业委员会委员。担任国际期刊《Artificial Intelligence in Medicine》《Data Intelligence》编委,国内核心期刊《医学信息学杂志》副主编。

主要研究方向:医学信息学,医学人工智能,数据挖掘技术。

李姣博士于2010年毕业于清华大学计算机系,获清华大学优秀博士论文;2010年-2012年,赴美国国立卫生研究院,从事医学信息学博士后研究工作;2012年至今,在中国医学科学院医学研究所从事科研和教学工作。作为课题负责人,承担国家重点研发计划“精准医学本体和语义网络构建”、国家自然科学基金“基于深层网络的药物基因组信息整合与药效预测研究”、北京自然科学基金重点项目,医学人工智能先导专项等课题研究。面向真实世界临床数据挖掘和面向人群的健康信息智能处理,开展数据感知、知识计算和人机交互技术研究,其研究成果发表在国际医学信息学领域核心期刊上,发表学术论文 90 余篇。获得专病知识图谱构建、智能膳食营养计算等发明专利 10 余项。

面向北京协和医学院研究生开设《医学数据挖掘实用技术》课程,参与《医学信息学》、《医学知识组织》、《应用生物信息学》等课程教学任务。创新教学手段,承担全国医药学研究生在线课程建设与教学研究重点课题《网络教学在医学大数据分析技能教育中的应用研究》。指导医学信息学专业研究生完成精准医学语义建模、医学影像报告生成、电子病历自然语言处理、临床指南知识表示等课题研究,毕业生就业情况良好,被评为市级、校级优秀毕业生。其本人获得北京协和医学院优秀教师、师德先锋等荣誉称号。


  • 研究方向Research Directions
医学信息学 ,医学人工智能 ,数据挖掘技术
2. 机电结构优化与控制 研究内容:在对机电结构进行分析和优化的基础上,运用控制理论进行结构参数的调整,使结构性能满足设计要求。1. 仿生结构材料拓扑优化设计, 仿生机械设计 研究内容:以仿生结构为研究对象,运用连续体结构拓扑优化设计理论和方法,对多相仿生结构(机构)材料进行2. 机电结构优化与控制 研究内容:在对机电结构进行分析和优化的基础上,运用控制理论进行结构参数的调整,使结构性能满足设计要求。1. 仿生结构材料拓扑优化设计, 仿生机械设计 研究内容:以仿生结构为研究对象,运用连续体结构拓扑优化设计理论和方法,对多相仿生结构(机构)材料进行整体布局设计。 整体布局设计。
报考意向
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学术学位博士
学术学位硕士
专业学位硕士
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其他材料:

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备注:
科研项目

主持科研项目:

[1] 国家重点研发计划,精准医学本体和语义网络构建

[2] 国家自然科学基金,基于深层网络的药物基因组信息整合与药效预测研究

[3] 国家重点研发计划,中国人群多组学参比数据库与分析系统建设

[4] 北京市自然科学基金重点项目,基于电子病历的动脉粥样硬化性脑血管病的临床表型自然语言理解研究

[5] 国家科技图书文献中心,科技文献图表结构化描述信息的提取方法研究

[6] 教育部留学回国人员科研启动经费,基于多核学习的语义关系提取算法研究

[7] 全国医药学研究生在线课程建设与教学研究重点课题,网络教学在医学大数据分析技能教育中的应用研究

[8] 医学与健康科技创新工程,医学人工智能算法评价标准库构建


代表性论文

[1] Xuwen Wang, Yu Zhang, Zhen Guo, Jiao Li*, TMRGM: A Template-Based Multi-Attention Model for X-Ray Imaging Report Generation, Journal of Artificial Intelligence for Medical Sciences, 2021, https://doi.org/10.2991/jaims.d.210428.002

[2] Si Zheng, Yun Xia Wu, Jiayang Wang, Yan Li, Zhongjun Liu, Xiaoguang Liu, Gengting Dang, Yu Sun, Jiao Li*, Identifying the Characteristics of Patients With Cervical Degenerative Disease for Surgical Treatment From 17-Year Real World Data: Retrospective Study, JMIR Medical Informatics, 2020. 8(4)e16076 

[3] Zidu Xu, Ji Geng, Shuai Zhang, Kexin Zhang, Lin Yang, Jing Li*, Jiao Li*. A Mobile-Based Intervention for Dietary Behavior and Physical Activity Change in Individuals at High Risk for Type 2 Diabetes Mellitus: Randomized Controlled Trial, JMIR MHEALTH AND UHEALTH, 2020, 8(10), e19869

[4] Haixia Sun, Jin Xiao, Wei Zhu, Yilong He, Sheng Zhang, Xiaowei Xu, Li Hou, Jiao Li*, Yuan Ni, Guotong Xie*. Medical Knowledge Graph to Enhance Fraud, Waste, and Abuse Detection on Claim Data: Model Development and Performance Evaluation, JMIR Medical Informatics, 2020,8(7),e17653.

[5]  Lu Qin, Xiaowei Xu, Lingling Ding, Zixiao Li*, Jiao Li*. Identifying diagnosis evidence of cardiogenic stroke from Chinese echocardiograph reports. BMC Medical Informatics and Decsion Making, 2020, https://doi.org/10.1186/s12911-020-1106-3

[6] Li Hou, Meng Wu, Hongyu Kang, Si Zheng, Liu Shen, Qing Qian, Jiao Li*. PMO: A knowledge representation model towards precision medicine, Mathematical Biosciences and Engineering, 2020. 17(4): 4098-4114. 

[7] Lin Yang, Xiaoshuo Huang, Jiao Li*. Discovering Clinical Information Models Online to Promote Interoperability of Electronic Health Records: A Feasibility Study of OpenEHR, Journal of Medical Internet Research, 2019. 21(5). 

[8] Feihong Yang, Haihong Guo, Jiao Li*, TestIME: An Application for Evaluating the Efficiency of Chinese Input Method Engines in Electronic Medical Record Entry Task, BMC Medical Informatics and Decision Making, 2019 

[9] Xuewen Wang, Yu Zhang, Zhen Guo, Jiao Li*. Identifying concepts from medical images via transfer learning and image retrieval, Mathematical Biosciences and Engineering, 2019. 16(4): 1978-1991.

[10] Xu Na, Haihong Guo, Yu Zhang, Liu Shen, Sizhu Wu, Jiao Li*. Mining Open Payments Data: Analysis of Industry Payments to Thoracic Surgeons From 2014-2016, Journal of Medical Internet Research, 2018. 20(11). 

[11] Xiaowei Xu, Ju Wang, Li Hou, Zhen Guo, Jiao Li*. A Dietary Management System Using Radio-Frequency Identification Technology to Collect Information on Chinese Food Consumption: Development and Feasibility Study. JMIR mHealth and Uhealth. 2018. 6(8). 

[12] Haihong Guo, Xu Na, Jiao Li*. Qcorp: an annotated classification corpus of Chinese health questions, BMC Medical Informatics and Decision Making, 2018. 181. 

[13] Yu Zhang, Xuwen Wang, Zhen Hou, Jiao Li*. Clinical Named Entity Recognition From Chinese Electronic Health Records via Machine Learning Methods, JMIR Medical Informatics. 2018, 6(4): 242-254.

[14] Jiao Li, Yueping Sun, Robin J. Johnson, et al. BioCreative V CDR task corpus: a resource for chemical disease relation extraction, DATABASE (Oxford), 2016. doi: 10.1093/database/baw068 

[15] Li Hou, Hongyu Kang, Yan Liu, Luqi Li, Jiao Li*. Mining and standardizing Chinese consumer health terms, BMC Medical Informatics and Decision Making, 2018. 185 

[16] Haihong Guo, Xu Na, Li Hou, Jiao Li*. Classifying Chinese Questions Related to Health Care Posted by Consumers Via the Internet. Journal of Medical Internet Research, 2017. 19(6).  

[17] 杨飞洪,孙海霞,李姣*,一种文本相似度与BERT模型融合的手术操作术语归一化方法,中文信息学报,2021,35(4): 44-50

[18] 覃露,徐晓巍,丁玲玲,黄晓硕,李子孝,李姣*. 面向决策支持的临床指南知识表示方法研究,中华医学图书情报杂志,2020,29(2):1-8

[19] 杨林,黄晓硕,王嘉阳,李姣*, 基于语义对齐的临床量表信息提取方法及其临床试验队列识别的应用研究,数据分析与知识发现,2020,4(12): 33- 44

[20] 黄晓硕,杨林,李姣* ,基于贝叶斯网络的临床信息模型检索方法研究: 以HL7 V3 为例,中国生物医学工程学报,2019,38(3):306-314

教学工作

课程教学:

[1] 研究生课程《医学数据挖掘实用技术》(春季学期),课程负责人

[2] 本科生课程《R语言程序设计与机器学习基础》(秋季学期),课程负责人  

[3] 研究生课程《医学知识组织》(春季学期),参与授课

[4] 研究生课程《医学信息学》(秋季学期),参与授课

[5] 《应用生物信息学》(秋季学期),参与授课

 

参编教材:

[1] 中华医学百科全书·医学信息学卷,中国协和医科大学出版社,2017,编委

[2] Computational Methods for Drug Repurposing,Nature Springer,2019,参编

[3] Bioinformatics and Drug Discovery,Nature Springer,2019,参编


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