1、正常人尿蛋白质组的动态分析/高等学校博士学科点专项科研基金（新教师基金）/课题负责人/2008.1-2010.12

2、尿蛋白质组的动态分析及其在Ⅱ型糖尿病肾病中的应用/高等学校全国优秀博士学位论文作者专项资金/课题负责人/2008.1-2012.12

3、中国人正常尿液蛋白质组和糖基化蛋白质组质谱数据库/国家科技基础条件平台建设基金/项目负责人/2008.1-2008.12

4、蛋白质组鉴定的生物信息学算法/基础所院所长基金/项目负责人/2008.1-2010.12

5、2型糖尿病肾病的糖基化尿蛋白质组学研究/国家自然科学基金面上项目/课题负责人/2010.1-2012.12

6、中国国民健康状况和基本生理参数本地调查/国家基础性研究专项/学术骨干/2013.6-2018.6

7、建立利用激光显微切割联合质谱蛋白质组学技术鉴定系统性淀粉样变性患者中致淀粉样变性蛋白类型的方法/国家自然科学基金面上项目/参与/2014.1-2014.12

8、人体泌尿系统蛋白质组表达谱/国家重点基础研究发展计划/学术骨干/2014.6-2018.6

9、尿蛋白质组学数据库/国家科技基础条件平台建设基金/项目负责人/2017.1-2017.12

10、脑胶质瘤蛋白质组数据库/国家科技基础条件平台建设基金/项目负责人/2017.1-2017.12

11、炎性肺损伤和修复的系统生物医学研究/中国医学科学院医学与健康科技创新工程（重大协同创新项目）/参与/2017.1-2020.12

12、体液蛋白质组学数据库/国家科技基础条件平台建设基金/项目负责人/2018.10-2019.10

13、脑干胶质瘤多中心临床大数据研究暨路径发生机制及精准诊疗转化研究/北京市重点研发项目/学术骨干/2019.11-2024.12

主要研究方向是基于质谱的多组学检测技术及其应用研究。

1、多组学检测方法的开发：包括样品收集、样品高通量处理，质谱分析方法，数据分析软件。

2、体液多组学分析：各种体液，包括血液、尿液、脑脊液、羊水、唾液、房水、泪液等多组学分析，用于寻找疾病相关的标志物。

3、肿瘤多组学分析：从基因组、蛋白质组、代谢组等多组学水平进行肿瘤分子分型，研究肿瘤发病机制和体液标志物。

4、大脑功能研究：利用多组学技术研究大脑的功能，提示各个脑区功能差别的分子基础。

2020

1. Yu M, Xie F, Liu X, Sun H, Guo Z, Liu X, Li W, Sun W*, Wang Y*, He C*. Proteomic Study of Aqueous Humor and Its Application in the Treatment of Neovascular Glaucoma. Front Mol Biosci. 2020 Oct 8;7:587677.

2. Luo CY, Li Y*, Li X, Liang X, Wang Q, Ma YH, Xiong CH, Zeng YP, Sun W*, Wang X. Alleviation of Lipopolysaccharide-Induced Acute Respiratory Distress Syndrome in Rats by Yiqi Huayu Jiedu Decoction: A Tandem Mass Tag-Based Proteomics Study. Front Pharmacol. 2020 Aug 28;11:1215.

3. Liu X#, Zhang M#, Liu X#, Sun H, Guo Z, Tang X, Wang Z, Li J, He L, Zhang W, Wang Y, Li H, Fan L, Tsang S, Zhang Y*, Sun W*. Investigation of Plasma Metabolic and Lipidomic Characteristics of a Chinese Cohort and a Pilot Study of Renal Cell Carcinoma Biomarker. Front Oncol. 2020 Aug 18;10:1507.

4. Hao X, Guo Z, Sun H, Liu X, Zhang Y, Zhang L, Sun W*, Tian Y*. Urinary protein biomarkers for pediatric medulloblastoma. J Proteomics. 2020 May 28:103832.

5. Liu X, Zhang M, Cheng X, Liu X, Sun H, Guo Z, Li J, Tang X, Wang Z, Sun W*, Zhang Y*, Ji Z*. LC-MS-Based Plasma Metabolomics and Lipidomics Analyses for Differential Diagnosis of Bladder Cancer and Renal Cell Carcinoma. Front Oncol. 2020 Aug 18;10:1507.

6. Li J, Li J, Zhao WG*, Sun HD, Guo ZG, Liu XY, Tang XY, She ZF, Yuan T, Liu SN, Liu Q, Fu Y, Sun W*. Comprehensive proteomics and functional annotation of mouse brown adipose tissue. PLoS One. 2020 May 6;15(5):e0232084.

7. Zhang M, Liu X, Liu X, Li H, Sun W*, Zhang Y*. A pilot investigation of a urinary metabolic biomarker discovery in renal cell carcinoma. Int Urol Nephrol. 2020;52(3):437–446.

2019

1. Shang C#, Sun W#, Wang C, Wang X, Zhu H, Wang L, Yang H, Wang X, Gong F, Pan H. Comparative Proteomic Analysis of Visceral Adipose Tissue in Morbidly Obese and Normal Weight Chinese Women. Int J Endocrinol. 2019 Dec 18;2019:2302753. 

2. Wang Z, Liu X, Liu X, Sun H, Guo Z, Zheng G, Zhang Y*, Sun W*. UPLC-MS based urine untargeted metabolomic analyses to differentiate bladder cancer from renal cell carcinoma. BMC Cancer. 2019 Dec 5;19(1):1195.

3. Zhao M, Liu X, Sun H, Guo Z, Liu X, Sun W*. Evaluation of Urinary Proteome Library Generation Methods on Data-Independent Acquisition MS Analysis and its Application in Normal Urinary Proteome Analysis. Proteomics Clin Appl. 2019 Sep;13(5):e1800152.

4. Zhao YX, Zhu HJ, Pan H, Liu XM, Wang LJ, Yang HB, Li NS, Gong FY*, Sun W*, Zeng Y*. Comparative Proteome Analysis of Epicardial and Subcutaneous Adipose Tissues from Patients with or without Coronary Artery Disease. Int J Endocrinol. 2019 Aug 25;2019:6976712.

5. Liu X, Zhang M, Liu X, Sun H, Guo Z, Tang X, Wang Z, Li J, Li H, Sun W*, Zhang Y*. Urine Metabolomics for Renal Cell Carcinoma (RCC) Prediction: Tryptophan Metabolism as an Important Pathway in RCC. Front Oncol. 2019 Jul 17;9:663.

6. Tang X, Li J, Zhao WG, Sun H, Guo Z, Jing L, She Z, Yuan T, Liu SN, Liu Q, Fu Y, Sun W*. Comprehensive map and functional annotation of the mouse white adipose tissue proteome. Peer J. 2019 Jul 25;7:e7352.

7. Chen X, Liu H*, Sun W, Guo Z, Lang J. Elevated urine histone 4 levels in women with ovarian endometriosis revealed by discovery and parallel reaction monitoring proteomics. J Proteomics. 2019 Jul 30;204:103398.

8. Shao C, Zhao M, Chen X, Sun H, Yang Y, Xiao X, Guo Z, Liu X, Lv Y, Chen X, Sun W*, Wu D*, Gao Y*. Comprehensive analysis of individual variation in the urinary proteome revealed significant gender differences. Mol Cell Proteomics. 2019 Jun;18(6):1110-1122

9. Zou L, Wang X, Guo Z, Sun H, Shao C, Yang Y, Sun W*. Differential urinary proteomics analysis of myocardial infarction using iTRAQ quantification. Mol Med Rep. 2019 May;19(5):3972-3988.

10. Sun H, Wang D, Liu D, Guo Z, Shao C, Sun W*, Zeng Y*. Differential urinary proteins to diagnose coronary heart disease based on iTRAQ quantitative proteomics. Anal Bioanal Chem. 2019 Apr;411(11):2273-2282.

11. Liu X, Wang X, Sun H, Guo Z, Liu X, Yuan T, Fu Y, Tang X, Li J, Sun W*, Zhao W*. Urinary metabolic variation analysis during pregnancy and application in Gestational Diabetes Mellitus and spontaneous abortion biomarker discovery. Sci Rep. 2019 Feb 22;9(1):2605. 

12. Liu X, Song Y, Guo Z, Sun W*, Liu J*. A comprehensive profile and inter-individual variations analysis of the human normal amniotic fluid proteome. J Proteomics. 2019 Feb 10;192:1-9.

2018

1.Liu X, Cheng X, Liu X, He L, Zhang W, Wang Y, Sun W*, Ji Z*. Investigation of the urinary metabolic variations and the application in bladder cancer biomarker discovery. Int J Cancer. 2018 Jul 15;143(2):408-418. 

2.Cheng X, Liu X, Liu X, Guo Z, Sun H, Zhang M, Ji Z*, Sun W*. Metabolomics of Non-muscle Invasive Bladder Cancer: Biomarkers for Early Detection of Bladder Cancer. Front Oncol. 2018 Nov 2;8:494.

3. Zhao M, Yang Y, Guo Z, Shao C, Sun H, Zhang Y, Sun Y, Liu Y, Song Y, Zhang L, Li Q, Liu J, Li M, Gao Y, Sun W. A Comparative Proteomics Analysis of Five Body Fluids: Plasma, Urine, Cerebrospinal Fluid, Amniotic Fluid, and Saliva. Proteomics Clin Appl. 2018 Nov;12(6):e1800008.

4．Guo Z, Wang Z, Lu C, Yang S, Sun H, Reziw, Guo Y, Sun W, Yue H. Analysis of the differential urinary protein profile in IgA nephropathy patients of Uygur ethnicity. BMC Nephrol. 2018 Dec 14;19(1):358.

5．Wang L, Sun W, Chang Y, Yi Z. Differential proteomics analysis of bile between gangrenous cholecystitis and chronic cholecystitis. Med Hypotheses. 2018 Dec;121:131-136.

2017

1.Liu X, Guo Z, Sun H, Li W*, Sun W*. Comprehensive Map and Functional Annotation of Human Pituitary and Thyroid Proteome. J Proteome Res. 2017 Aug 4;16(8):2680-2691.

2.Liu X, Guo Z, Liu W, Sun W*, Ma C*. Differential proteome analysis of hippocampus and temporal cortex using label-free based 2D-LC-MS/MS. J Proteomics. 2017 Aug 8;165:26-34.

3.Guo Z, Cheng J, Sun H, Sun W*. A qualitative and quantitative evaluation of the peptide characteristics of microwave- and ultrasound-assisted digestion in discovery and targeted proteomic analyses. Rapid Commun Mass Spectrom. 2017 Aug 30;31(16):1353-1362.

4.Xiao X, Liu Y, Guo Z, Liu X, Sun H, Li Q*, Sun W*. Comparative proteomic analysis of the influence of gender and acid stimulation on normal human saliva using LC/MS/MS. Proteomics Clin Appl. 2017 Jul;11(7-8).

5.Zhao M, Li M, Yang Y, Guo Z, Sun Y, Shao C, Li M, Sun W*, Gao Y*. A comprehensive analysis and annotation of human normal urinary proteome. Sci Rep. 2017 Jun 8;7(1):3024.