国家新药（微生物）筛选实验室是1998年由科技部生命科学发展中心根据新药研发“1035”工程牵头依托中国医学科学院医药生物技术研究所筹建的五个国家新药筛选实验室（中心）之一，于2000年11月通过科技部生命科学发展中心组织的专家验收。

国家新药（微生物）筛选实验室核心实验室现有司书毅课题组和肖春玲（刘忆霜）课题组，工作人员共有15人，有研究员2人，副研究员6人，助理研究员6人，主管技师1名。其中，有博士学位的11名。现有博士研究生5人，硕士研究生7名。实验室面积为408平方米。

司书毅课题组现拥有科研人员10名，其中研究员、副研究员5名，均具有博士学位；助理研究员3名，新入职博士毕业生2名。在读博士研究生5名，在读硕士研究生5名。主要研究方向为基于微生物次级代谢产物及合成化合物库的新型抗耐药细菌、结核杆菌和真菌、抗流感病毒药物及新型抗代谢药物筛选与发现研究、基于先导物的新型药物靶标发现及分子药理学研究，以及新型抗感染、抗代谢药物候选物研发研究。课题组近10年来发表SCI论文60余篇。

1.国家自然科学基金重点项目：抗肿瘤、抗病毒及心血管药物筛选新模型的研究及应用，80万元，2000,1-2002.12

2.国家十五重大攻关项目“创新药物与中药现代化”中新药筛选关键技术课题分课题——“创新性抗感染抗炎药物高效筛选技术研究与应用”，300万（2002.10-2004.6）   “创新性抗感染抗炎药物高效筛选技术研究与应用” 350万（2004.7-2005.12）    

3. 十一五国家科技重大专项：“重大新药创制”   新药研发技术平台新药筛选单元平台——    “创新微生物药物高效筛选与发现技术平台研究”    1991万   （2009.1-2010.12）

 4. 十二五国家科技重大专项：“重大新药创制”子课题：“创新微生物药物高效筛选与发现技术平台研究” 816万 （2012-2015）    

5. 十三五国家科技重大专项：“重大新药创制”任务“微生物药物高效发现与快速研发关键技术创新体系” 520万 （2018-2020）

6.   十三五国家科技重大专项：“重大新药创制”子课题 “天然来源药物发现技术平台建设”   310万 （2018-2020）

自2000年起先后主持过国家自然科学基金重点项目1项，国家十五科技攻关项目“创新药物与中药现代化”中新药筛选关键技术平台“创新抗感染药物及抗炎药物高效筛选关键技术平台研究”、十一五、十二五国家重大专项“重大新药创制”项目“创新微生物药物高效筛选与发现技术平台研究”和十三五国家科技重大专项，以及科技部国际合作项目1项，国家自然科学基金面上项目3项。

建立了我国创新微生物药物与抗感染药物高效筛选平台，包括微生物发酵产物提取品库和天然与合成化合物库，建立了具有微生物药物活性特色的筛选体系，完成了700万样次的药物筛选，我国创新微生物药物高效筛选的规模和水平到达国际先进水平，已经获得一批新型抗感染药物候选物和新型抗动脉粥样硬化药物候选物。

在国内外包括Nature medicine, PNAS, JMC，JAC及JLR等专业刊物上发表论文160余篇，其中SCI收录论文110余篇;主编了《药物筛选-方法与实践》和主译了《药学微生物学》。申请国家发明专利30余项，国际专利4项，已获得24项专利证书。多次被评为北京协和医学院优秀教师和研究生评选的“优秀授课老师”。已培养毕业博士研究生42名，正在培养博士研究生4名，其中，所毕业的博士生多人获得国家奖学金，北京市优秀毕业生称号，北京协和医学院优秀博士论文奖和研究所的大村智-甄永苏五四青年论文奖。