主要研究方向

1）3D基因组结构调控细胞命运决定

2）骨骼肌成体干细胞、再生、衰老与骨骼肌退行性疾病

3）骨骼肌与肝脏/脂肪“对话”调控慢性代谢病的分子机制

       采用转基因和敲除小鼠动物模型，结合遗传示踪、细胞生物学、生物化学、计算生物学和DNA/RNA成像可视化，从染色质高级结构和代谢微环境角度解析骨骼肌干细胞命运调控再生、衰老及骨骼肌退行性疾病发生的分子机制。采用代谢流、代谢成像、脂质成像等技术，揭示骨骼肌代谢调节机体能量稳态及其在慢性代谢性疾病中的功能。以此为基础研发干预或治疗骨骼肌退行性疾病（肌营养不良-罕见病、老年肌少症-常见病）、慢性代谢病（肥胖症、II型糖尿病、非酒精性脂肪肝NAFLD）的药物。详见实验室主页：http://sbm.pumc.edu.cn/article/11512

学生培养

本课题组培养的学生毕业后已分别在教学、科研和医药研究领域和企业成为教授、副教授和管理人才。

5人次获得国家奖学金（孟姣、樊悦、翟丽丽、李虎、万鑫）

4人次获得国家一等奖学金（于潇华、翟丽丽、汪瑞婷、万鑫）

5人次优秀毕业生（孟姣、樊悦、翟丽丽、李虎、万鑫）

2人次吴宪优秀研究生（张潜英、汪瑞婷）

1人次优秀毕业生校长奖（万鑫）

近五年承担项目：

1、作为首席科学家承担国家重点研发 “发育编程及其代谢调节”专项，项目名称“代谢微环境对骨骼肌发育和稳态维持的调控作用与机制”（项目编号2022YFA0806000）；作为课题2负责人，课题名称“代谢微环境分子调控骨骼肌祖/干细胞不对称分裂和命运决定的分子机制” （2022YFA0806002），2022/12-2027/11。

2、国家重点研发 “干细胞研究与器官修复”专项参与人，课题名称“干细胞命运决定过程中胞核无膜颗粒小体及相关非编码RNA的调控功能研究”（2021YFA1100202），2021/12-2026/06。

3、作为参与人，参加中国医学科学院医学与健康科技创新工程重大协同创新项目，项目名称“组织干细胞的发育、稳态及应用研究”（2021-I2M-1-019），2021/10-2025/12。

4、国家自然科学基金面上项目，31971080，骨骼肌特异长非编码Linc-RAM调控骨骼肌代谢和机体代谢稳态的生理功能及其分子机制，2020/01-2023/12，项目负责人。已结题。

5、国家自然科学基金重大研究计划培育项目，91949106，长非编码RNA Linc-RAM在Ageing导致的骨骼肌肌少症发生发展中的功能与分子机制，2020/01-2022/12，项目负责人。已结题。

6、北京市自然科学基金面上项目，7192125，长非编码Linc-RAM介导骨骼肌与脂肪代谢互作调控机体代谢稳态的分子机制，2019/01-2021/12，项目负责人。已结题。

7、科技部973-重大科学研究计划项目，2015CB943103，骨骼肌与脂肪细胞转换关键因子的鉴定及功能，2015/01-2019/12，课题负责人。已结题。

近五年承担项目：

1、作为首席科学家承担国家重点研发 “发育编程及其代谢调节”专项，项目名称“代谢微环境对骨骼肌发育和稳态维持的调控作用与机制”（项目编号2022YFA0806000）；作为课题2负责人，课题名称“代谢微环境分子调控骨骼肌祖/干细胞不对称分裂和命运决定的分子机制” （2022YFA0806002），2022/12-2027/11。

2、国家重点研发 “干细胞研究与器官修复”专项参与人，课题名称“干细胞命运决定过程中胞核无膜颗粒小体及相关非编码RNA的调控功能研究”（2021YFA1100202），2021/12-2026/06。

3、作为参与人，参加中国医学科学院医学与健康科技创新工程重大协同创新项目，项目名称“组织干细胞的发育、稳态及应用研究”（2021-I2M-1-019），2021/10-2025/12。

4、国家自然科学基金面上项目，31971080，骨骼肌特异长非编码Linc-RAM调控骨骼肌代谢和机体代谢稳态的生理功能及其分子机制，2020/01-2023/12，项目负责人。已结题。

5、国家自然科学基金重大研究计划培育项目，91949106，长非编码RNA Linc-RAM在Ageing导致的骨骼肌肌少症发生发展中的功能与分子机制，2020/01-2022/12，项目负责人。已结题。

6、北京市自然科学基金面上项目，7192125，长非编码Linc-RAM介导骨骼肌与脂肪代谢互作调控机体代谢稳态的分子机制，2019/01-2021/12，项目负责人。已结题。

7、科技部973-重大科学研究计划项目，2015CB943103，骨骼肌与脂肪细胞转换关键因子的鉴定及功能，2015/01-2019/12，课题负责人。已结题。

代表性论文：*通讯作者

1. XinWan, Jie Kong, Xiaodi Hu, Yuanping Yang, Hu Li, Gaoao Liu, Xingchen Niu, DanZhang, Dahai Zhu*, Yong Zhang*.Simultaneous Imaging of Chromatin Loops and Active Transcription in LivingCells (SiCLAT). Genome Biology. In Revision. 2023 IF: 12.3

2. RuiqingWang#, Chao Ren#, Tian Gao#, Hao Li, Xiaochen Bo, Dahai Zhu, Dan Zhang*, HebingChen*, Yong Zhang*. SEPDB: a database of secreted proteins. Database(Oxford). 2024 Feb 12;2024:baae007. 

3. Yuting Liu#, Xin Wan#, Hu Li#, YingxiChen, Xiaodi Hu, Hebing Chen, Dahai Zhu*, Cheng Li*, Yong Zhang*. CTCF coordinates cell fate specification viaorchestrating regulatory hubs with pioneer transcription factors. CellReports. 2023 Oct 17;42(10):113259. 2023 IF: 8.8

4. XiaodiHu#, Mingwei Sun#, Qian Chen, Yixia Zhao, Na Liang, Siyuan Wang, Pengbin Yin,Yuanping Yang, Sin Man Lam, Qianying Zhang, Alimujiang Tudiyusufu, Yingying Gu,Xin Wan, Meihong Chen, Hu Li, Xiaofei Zhang, Guanghou Shui, Suneng Fu, LichengZhang, Peifu Tang, Catherine C.L. Wong, YongZhang*, Dahai Zhu*. Skeletal muscle-secreted DLPC orchestrates systemicenergy homeostasis by enhancing adipose browning. Nature Communications.2023 Nov 30;14(1):7916. 2023 IF: 16.6

5. Aging Biomarker Consortium. The AgingBiomarker Consortium represents a new era for aging research in China. NatureMedicine. 2023 Sep;29(9):2162-2165. 2023 IF: 82.9

6. Aging Biomarker Consortium. Biomarkers ofaging. Sci China Life Sci. 2023 May;66(5): 893-1066. 2023 IF: 9.1

7. Ruiting Wang, Fengling Chen, Qian Chen, Xin Wan, Minglei Shi,Antony K. Chen, Zhao Ma, Guohong Li, Min Wang, Yachen Ying, Qinyao Liu, Hu Li,Xu Zhang, Jinbiao Ma, Jiayun Zhong, Meihong Chen, Michael Q. Zhang*, Yong Zhang*, Yang Chen* & DahaiZhu*. MyoD is a 3D genome structure organizerfor muscle cell identity. Nature Communications. 2022 Jan11;13(1):205. 2023 IF: 16.6

8. Hu Li, Qian Chen, Changyin Li, Ran Zhong,Yixia Zhao, Qianying Zhang, Weimin Tong, Dahai Zhu*, and Yong Zhang*. Muscle-secreted granulocyte colony-stimulating factorfunctions as metabolic niche factor ameliorating loss of muscle stem cells inaged mice. EMBO Journal. 2019 Dec 16;38(24):e102154. 2023 IF: 11.4

9. Yixia Zhao, Fengqi Cao, Xiaohua Yu, ChuyanChen, Jiao Meng, Ran Zhong, Yong Zhang*,Dahai Zhu*. Linc-RAM is required for FGF2 function in regulating myogenic celldifferentiation. RNA Biology. 2018 Mar 4;15(3):404-412. 2023 IF: 4.1

10. Lili Zhai, Rimao Wu, Wanhong Han, Yong Zhang* and Dahai Zhu*. miR-127enhances myogenic cell differentiation by targeting S1PR3. Cell Death & Disease.2017. Mar 30;8(3):e2707. 2023 IF: 9

11. Xiaohua Yu#, Yong Zhang#*, Tingting Li, Zhao Ma, Haixue Jia, Qian Chen, YixiaZhao, Lili Zhai, Ran Zhong, Changyin Li, Xiaoting Zou, Jiao Meng, Antony K.Chen, Pier Lorenzo Puri, Meihong Chen, and Dahai Zhu*. Long non-coding RNA Linc-RAMenhances myogenic differentiation by interacting with MyoD. Nature Communications. 2017. Jan16;8:14016. 2023 IF: 16.6

12. Xiaoting Zou, Jiao Meng, Li Li, WanhongHan, Changyin Li, Ran Zhong, Xuexia Miao, Jun Cai, Yong Zhang* and Dahai Zhu*. Acetoacetate accelerates muscleregeneration and ameliorates muscular dystrophy in mice. J Biol Chem. 2016 Jan29;291(5):2181-95. 2023 IF: 4.8

13. Rimao Wu, Hu Li, Lili Zhai, Xiaoting Zou, Jiao Meng,Ran Zhong, Changyin Li, Haixia Wang, Yong Zhang*, Dahai Zhu*.MicroRNA-431 accelerates muscle regeneration and ameliorates muscular dystrophyby targeting Pax7 in mice. NatureCommunications. 2015 Jul 7;6:7713. 2023 IF: 16.6

14. YongZhang, Changyin Li, Hu Li, Yipeng Song, Yixia Zhao, Lili Zhai, Haixia Wang,Ran Zhong, Huiru Tang, and Dahai Zhu*. miR-378 Activates the Pyruvate-PEPFutile Cycle and Enhances Lipolysis to Ameliorate Obesity in Mice. EBioMedicine. 2016. Mar 11;5:93-104. 2023 IF: 11.1

15. Yong Zhang, Jie Wang, Shoujun Huang, Xiaopeng Zhu, Jun Liu, Ning Yang, Dandan Song,Rimao Wu, Wei Deng, Geir Skogerbø, Xiu-Jie Wang, Runsheng Chen, Dahai Zhu*.Systematic identification and characterization of chicken (Gallus gallus)ncRNAs. Nucleic Acids Research.2009 Oct;37(19):6562-74. 2023 IF: 14.9

授权或申请专利

1、发明名称：miR-431在制备治疗肌肉疾病的药物中的用途

发 明 人：朱大海，武日茂，翟丽丽，张勇

专 利 号：ZL 2014 1 0496029.3

专利申请日：2014年9月25日

专利权人：中国医学科学院基础医学研究所

授权公告日：2017年2月15日

2、发明名称： miR-127 在制备治疗肌肉疾病的药物中的用途

发 明 人：朱大海 张勇 翟丽丽 武日茂

专 利 号：ZL 2016 1 0073384.9

专利申请日：2016 年2 月2 日

专利权人：中国医学科学院基础医学研究所

授权公告日：2020年6月19日

3、发明名称：甘油磷脂类化合物在治疗肿瘤中的用途

申 请 人：中国医学科学院基础医学研究所

发 明 人：朱大海 张勇 陈梅红 韩春苗 苗仁玲

申 请 日：2021年5月17日

申 请 号：202110534893.8

PCT申请日：2022年2月16日

PCT申请号：PCT/CN2022/076394

国际公布日：2022年11月24日

国际公布号：WO 2022/242251 A1

专 利 号：ZL 2021 1 0534893.8

授权公告日：2024年04月02日

授权公告号：CN 115364111 B

4、发明名称：甘油磷脂类化合物在预防和治疗高血脂、动脉粥样硬化、非酒精性脂肪肝和肥胖中的用途

申 请 人：中国医学科学院基础医学研究所

发 明 人：朱大海 张勇 李虎 陈梅红 胡晓娣 梁娜

申 请 日：2022年9月29日

申 请 号：202211203206.5

PCT申请日：2022年11月1日

PCT申请号：PCT/CN2022/128845

国际公布日：2024年3月28日

国际公布号：WO 2024/060359 A1

5、发明名称：在活细胞中实时示踪基因组空间构象和转录产物的构建体及其用途

申 请 人：生物岛实验室；中国医学科学院基础医学研究所

发 明 人：朱大海；张勇；万鑫；李虎

申 请 日：2023年7月4日

申 请 号：2023108132794

国际申请号：PCT/CN2023/115228

国际申请日：2023年8 月28 日