孙明PI组致力于以HIV-1抗体为代表的新型中和抗体及作用机制的研究。主要包括利用单个B细胞高通量分选技术分选单抗、对候选抗体不同中和模式及效力的关系探讨、体内抗体基因的高效递送与表达等研究，PI组依托病原学、免疫学和抗体工程建立的技术体系，围绕中和抗体抗病毒机制、新型抗体的获得、应用和转化等方面进行探索。

     目前，孙明PI组与北京协和医院李太生教授合作，围绕HIV-1治疗性抗体的分选、改造、单抗免疫治疗对功能性治愈的潜在作用、长期不进展者的样本特征、抗病毒特点及病程不进展的免疫学分析等方面进行研究；与中山大学孙力涛教授围绕病原体的潜在活性抗体的相互作用、抗原抗体结合的模型及结构解析、表位特征和相应效力等开展研究。同时，本PI组与哥伦比亚大学艾伦戴蒙德艾滋病研究中心保持抗体研究的学术交流，以上合作可为本课题组的研究提供有力的技术支持。

      孙明PI组目前有2名研究助理，1名技术员，联合培养博士研究生3名（已毕业），在读研究生4名，联培研究生4名，现阶段在围绕抗体优化及改造、工程化抗体库构建及相关样本的特征分析开展研究，后续将围绕抗体亚型（IgM和IgA）转换和作用机制、抗体亲和力成熟、抗体转化相关因子及抗体广谱度产生的原因及病毒与抗体共进化等理论进行深入探讨，并着眼于新型抗体工程化技术、反向疫苗学关键技术等研究和运用，尤其是新型治疗性抗体的递送、效率和运用、基于抗体高效筛选识别抗原的莅临和技术完善。

近年主持项目 

1.   云南省“兴滇英才”支持计划创新团队专项，2024/01-2026/12，202405AS350026，100万元，在研，主持；

2.   医科院医学与健康科技创新工程重大协同创新项目子课题，广谱/多价疫苗与抗病毒生物药关键技术和产品研发-疱疹性咽峡炎治疗性IgM抗体的临床前研究，2022-I2M-CoV19-007，2022/07-2024/06，50万元，在研，主持；

3.   医科院医学与健康科技创新工程重大协同创新项目子课题，2021-I2M-1-043，创新疫苗关键技术研究—新冠病毒抗体特异性膜抗原筛选亚单位疫苗的技术体系， 2021/10-2025/12，125万元，在研，主持；

 4.   云南省卫健委医学学科带头人培育项目，D-2019022，新型HIV-1工程化抗体基因长效递送的效力研究，2021/01-2023/12，24万元，在研，主持;

5.   云南省重点研发计划（国合专项），2018IA044，HIV-1新型双因子抗体的设计、制备和效力评价，2018/01-2021/12，130万元，结题，主持；

6.   国家自然科学基金常规面上项目，31670945，HIV-1交叉中和抗体iMab/10E8中和病毒的基本作用机制，2017/01-2020/12，60万元，结题，主持；

7.   医科院医学与健康科技创新工程重大协同创新项目子课题，2017-12M-2-006，高突变病毒疫苗在不同感染模型的中和效力评价，2017/01-2020/12，160万，结题，主持；

8.   北京协和医院合作课题，HIV-1精英控制者抗病毒全功能扫描和中和抗体分选的研究，2017/01-2021/12，95万元，结题，共同主持；

9.   中央科研基本业务费项目，2016ZX350071，对10E8/iMab阻断HIV-1细胞间传播效力增强和优化的抗体工程化研究，2016/11-2017/11年，40万元，结题，主持；

10. 云南省登革热联合实验室开放式基金（2016ynvdklop01）： HIV-1 抗体VRC01中和病毒的基本特征研究 ，2016-2019，15万元；

孙明PI组人员课题：

1.  云南省基础研究专项，202301AT070363，氨基酸多态性对新型冠状病毒复制适应性及逃逸抑制效应的机制研究；2023/06-2026/05;

2.  云南省基础研究专项，202101AU070124，HIV-1长期不进展者糖依赖抗体与病毒的相互作用机制研究，2021/06-2024/05；

3.  云南省检验医学重点实验室开放课题，JYZDSYS202004， 双因子抗体递送对HIV-1感染人源化小鼠的效应机制，2021/01-2023/12；

4.  中央高校基本科研业务费青年教师项目，3332020065，HIV-1 V3C3区突变对细胞融合、侵入、复制及逃逸的机制研究，2020/01-2021/12；

5.  云南省检验医学重点实验室开放课题，JYZDSYS2021001， SARS-CoV-2抗血清的抗体特征和功能分析 ，2021/09-2022/12。

1.   云南省“兴滇英才”支持计划创新团队专项，202405AS350026，2024/01-2026/12，100万元，在研，主持；

2.   医科院医学与健康科技创新工程重大协同创新项目子课题，广谱/多价疫苗与抗病毒生物药关键技术和产品研发-疱疹性咽峡炎治疗性IgM抗体的临床前研究，2022-I2M-CoV19-007，2022/07-2024/06，50万元，在研，主持；

3.   医科院医学与健康科技创新工程重大协同创新项目子课题，2021-I2M-1-043，创新疫苗关键技术研究—新冠病毒抗体特异性膜抗原筛选亚单位疫苗的技术体系， 2021/10-2025/12，125万元，在研，主持；

 4.   云南省卫健委医学学科带头人培育项目，D-2019022，新型HIV-1工程化抗体基因长效递送的效力研究，2021/01-2023/12，24万元，在研，主持;

 5.   云南省重点研发计划（国合专项），2018IA044，HIV-1新型双因子抗体的设计、制备和效力评价，2018/01-2021/12，130万元，结题，主持；

 6.   国家自然科学基金常规面上项目，31670945，HIV-1交叉中和抗体iMab/10E8中和病毒的基本作用机制，2017/01-2020/12，60万元，结题，主持；

 7.   医科院医学与健康科技创新工程重大协同创新项目子课题，2017-12M-2-006，高突变病毒疫苗在不同感染模型的中和效力评价，2017/01-2020/12，160万，结题，主持；

 8.   北京协和医院合作课题，HIV-1精英控制者抗病毒全功能扫描和中和抗体分选的研究，2017/01-2021/12，95万元，结题，共同主持；

 9.   中央科研基本业务费项目，2016ZX350071，对10E8/iMab阻断HIV-1细胞间传播效力增强和优化的抗体工程化研究，2016/11-2017/11年，40万元，结题，主持；

10.   云南省登革热联合实验室开放式基金（2016ynvdklop01）： HIV-1 抗体VRC01中和病毒的基本特征研究 ，2016-2019，15万元。

近年代表性论著

 1.      Neutralising antibodies against human metapneumovirus，The LancetMicrobe.  doi:10.1016/S2666-5247(23)00134-9. Epub 2023 Jul 24.

2.      Dual blockages of a broadandpotent neutralizing IgM antibody targeting GH Loop of EV-As, Immunology，2023 Feb 1.doi:10.1111/imm.13629；

3.      S Trimer Derived  fromSARS-CoV-2 B.1.351 and B.1.618 Induced Effective Immune Response against Multiple SARS-CoV-2 Variants, Vaccines (Basel), 2023 Jan 16;11(1):193;

4.       Different T-cell and B-cell repertoire elicited by the SARS-CoV-2inactivated vaccine andS1 subunit vaccine in rhesus macaques. Hum Vaccin Immunother, 2022 Nov 30;18(6):2118477;

5.       Construction of Machine Learning Models to Predict Changes in Immune Function Using Clinical Monitoring Indices in HIV/AIDS Patients After9.9-Years of Antiretroviral Therapy in Yunnan, China. Frontiers in Cellular andInfection Microbiology. 2022，12:867737;

6.       Clinical and antibody characteristics reveal diverse signatures ofsevere and non‑severe SARS‑CoV‑2patients.  Infect Dis Pov.，2022,Feb 2;11(1):15.doi:10.1186/s40249-022-00940-w;

7.       Epigenetic glycosylation of SARS-CoV-2 impact viral infection through DC & L-SIGN receptors. iScience.  2021, Dec 17; 24(12):103426;

8.       Variations in Env at Amino Acids 328 and 330 Affect  HIV-1Replicative Fitness and Entry Inhibitor Sensitivity. Virus Research,  2021，Jul2;299:198424；

9.       Characteristics of the tree shrew humoral immune system. Mol Immuno. 2020， Nov;127:175-185.doi:10.1016/j.molimm.2020.09.009.

10.    COVID-19 coronavirus vaccine T cell epitope prediction analysis based on distributions of HLA class Iloci (HLA-A, -B, -C) across global populations. Hum Vaccin Immunother.，2021，Apr3;17(4):1097-1108；

11.    Identification of T CellEpitopes in the Spike Glycoprotein ofSevere Acute Respiratory SyndromeCoronavirus 2 in Rhesus Macaques. J Immunol., 2021 Jun1;206(11):2527-2535；

12.    High APRIL Levels Are AssociatedWith Slow Disease Progressionand Low Immuny Activation in ChronicHIV-1-Infected Patients. Front.Med.,17July, 2020 Jul 17;7:299；

13.    Single B Cells Reveal the Antibody Responses of Rhesus Macaques Immunized with an Inactivated Enterovirus D68 Vaccine. ArchVirol.2020,Aug;165(8):1777-1789；

14.    Novel pathways of HIV latency reactivation revealed by integrated analysis of transcriptome and target profile of bryostatin. Scientific Reports,2020, 10(1): 3511；

15.    Broadly neutralizingantibodies for  HIV-1:efficacies,challenges and opportunities. EmergMicrobes Infect. 2020Dec;9(1):194-206,  DOI:10.1080/22221751.2020.1713707；

16.    A Novel Neutralizing Antibody Specific to the DE Loop of VP1 CanInhibit EV-D68Infection in Mice.  J Immunol.,2018 Nov 1, 201(9):2557~2569；

17.    In Vivo Production of Monoclonal Antibodies by Gene Transfer via Electroporation Protects against Lethal Influenza and Ebola Infections, MolTher-MethClinD.,  2017, Dec 15, 7: 74~82;

18.    Nasal Infection of EnterovirusD68 Leading to Lower Respiratory Tract Pathogenesis  in Ferrets (Mustelaputorius furo). Viruses，2017，May, 9(5): 104；

19.    Functional effector memory T cells contribute to protection from super infection with heterologoussimian immunodeficiency virus or simian-human immunodeficiency virus isolates in Chinese rhesus macaques, ArchVirol.,2017,162(5):1211-1221;

20.    VRC01antibody protects against vaginal and rectal transmission ofhuman immunodeficiency virus 1 in hu-BLT mice, Arch Virol.，2016,9,161(9):2449~2455;

21.    Recent Progress towards Engineering-HIV1-Specific Neutralizing Monoclonal Antibodies. Front Immunol. , 2016.9.30, 7:391；

22.    DistinctHIV-1 Neutralization Potency Profiles of Ibalizumab-Based Bispecific Antibodies. J Acquir Immune Defic Syndr. 2016Dec1,73(4):365-373；

23.    Engineered Bispecific Antibodieswith ExquisiteHIV-1-Neutralizing Activity. Cell.，2016，Jun 16,165(7):1621-1631.

抗体专利：

1. 广谱中和抗EV71、CA16、CA10和CA6IgM型单克隆抗体及应用，申请号2020100603269，已授权

2. 一种抗HIV单克隆抗体的及其制备方法和运用，授权号：ZL 2020 1 0575564.3 已授权

3. An Anti-HIV Monoclonal Antibody and a Method for Preparing and Use ThereOf. Patent number:2020104082，已授权

4. ANTI-EV-D68 MONOCLONAL ANTIBODY AND PREPARATION METHOD AND USE THEREOF. Patent number:2029160,已授权

专著

1.      孙明*，刘喜成*，白剑*，李欣，龙海亭，李冰香，戴青，陈咏，程志晖，李悦，李亚丽，焦阳，苗兰英，裴宇鹏，刘鸿，林大勇，蒋宁，王金昌等。《实用细胞与分子生物学技术-抗体工程》，西安交通大学出版社，ISBN978-7-5605-9097-4，562千字，2016，9